Aberto ao público em Julho de 2014, resulta da transformação do anterior Museu Antoniano num novo espaço expositivo, ampliado e totalmente reformulado. O motivo de interesse não tem nada que enganar. Localizado na zona histórica da cidade, junto à Igreja de Santo António, próximo da Sé, este núcleo do Museu de Lisboa dá a conhecer a figura do Santo, com destaque para a sua relação com Lisboa, cidade onde nasceu e viveu até aos 20 anos. Este é um daqueles espaços que encerra aos feriados, excluindo obviamente o célebre de Junho, efeméride municipal e dia do santo que inspira a casa.
Com uma área de exposição de longa duração e centro de documentação, além de objetos de culto e de iconografia do Santo, há peças sobre as Festas de Lisboa ou Tronos de Santo António e ainda vídeos com várias personalidades (de Maria Bethânia a Carminho) a contarem alguns milagres de Santo António (Maria Betânia, Carminho, etc). Ah e um um painel interactivo que permite tirar fotografias no Museu com vários cenários.